Beherrschung der IT-Tools
Lab Linux® Bash und Shell
Lernen Sie, die Leistungsfähigkeit der Befehlszeile mit unserem Linux® Bash-Labor zu beherrschen, das speziell für die Manipulation von Spalten und Schlüsselwörtern in PDB-Dateien aus dem Bereich Biologie entwickelt wurde!
Im Bereich der Biologie, wo Daten oft umfangreich und komplex sind, sind Kenntnisse im Umgang mit Dateien und in der Suche nach Schlüsselwörtern unerlässlich, um diese Daten effektiv zu analysieren und zu visualisieren.
Wir bringen Ihnen die Grundlagen von Bash bei, einem leistungsstarken Tool, das in Unix- und Linux-Umgebungen verwendet wird und es Ihnen ermöglicht, sich wiederholende Datenaufgaben zu automatisieren und unter anderem serielle Analysen durchzuführen.
Ob Sie neu im Programmieren sind oder Ihre Fähigkeiten ergänzen möchten, Unsere maßgeschneiderte Praxisarbeit führt Sie durch praktische Beispiele und konkrete Übungen zu Dateien und Verzeichnissen mit Shell und AWK.
Lab Python3™
Python3™ profitiert von einer aktiven und vielfältigen Entwicklergemeinschaft, was bedeutet, dass eine Fülle von Ressourcen, Bibliotheken und Modulen für die unterschiedlichsten Anforderungen verfügbar ist. Da es in der Industrie allgemein weit verbreitet ist, stellt es aufgrund seiner ständigen Weiterentwicklung garantiert eine interessante Unterstützung dar, weshalb wir es in unsere Ausbildung integrieren.
Die analytische Erforschung der Alzheimer-Krankheit wird die Grundlage dieser praktischen Arbeit sein. Sie haben die Möglichkeit, spezielle Fähigkeiten in der erweiterten Sortiermanipulation zu erwerben, mit einem Schwerpunkt auf syntaktischer Klarheit und Vielseitigkeit dieser Sprache. Mit diesem Training werden Sie in der Lage sein, die Techniken des Managements von Dateien mit komplexen Daten zu beherrschen, Die Ergebnisse der Studie zeigen, dass die Proteinmoleküle an der Pathogenese der Alzheimer-Krankheit beteiligt sind. Durch die Manipulation dieser Daten mit Python TM können Sie relevante Informationen extrahieren, Struktur-Beziehungen identifizieren undDie Ergebnisse dieser Studie werden in Form von Daten und Daten über die Krankheitsentwicklung, die Krankheitssymptome und Krankheitsverläufe sowie die Diagnose und Behandlung von Krankheiten untersucht. Dieser wissenschaftliche Ansatz ermöglicht es Ihnen, interessante Daten zu manipulieren und einen wesentlichen Beitrag zum Verständnis der Forschung in diesem Bereich zu leisten.
Diese Labo können auf verschiedenen Betriebssystemen wie Windows®, macOS® und Linux® ausgeführt werden, was den Benutzern große Flexibilität bietet.
Lab 1: Einarbeitung, Dauer 8 Stunden
Lab 2: Sortierung, Dauer 8 Stunden
Lab 3: Vorstellung, Dauer 8 Stunden
LabPreis: 1 000 Euro inkl. MwSt. pro Einheit
Sprachen: Englisch oder Französisch
Labs AutoDock / Autodock Vina
Diese intensive praktische Arbeit unter der Leitung von Bioinformatik-Experten soll Ihnen ein tiefgreifendes Verständnis der Theorie und Praxis des molekularen Dockings über Autodock vermitteln. Sie lernen, es und seine Suiten zu nutzen, um die molekularen Wechselwirkungen zwischen Zielproteinen und ihren Liganden vorherzusagen und die Ergebnisse Ihrer Simulationen zu interpretieren und zu analysieren.
Hier ist eine Übersicht, was Sie lernen werden:
Die grundlegenden Prinzipien des molekularen Docking verstehen.
Beherrschen Sie die Autodock-Befehle und ihre erweiterten Funktionen.
Bereiten Sie Ihre Protein- und Ligandenstrukturen effizient für die Simulation vor.
Optimieren Sie Simulationsparameter für genaue Ergebnisse.
Analysieren und interpretieren Sie Docking-Ergebnisse als Leitfaden für die Arzneimittelentwicklung.
Entdecken Sie reale Anwendungsfälle und Fallstudien für die praktische Anwendung.
Unabhängig davon, ob Sie ein Bioinformatik-Forscher oder ein Doktorand sind, vermittelt Ihnen diese Schulung die Fähigkeiten, die Sie benötigen, um beim molekularen Andocken mit Autodock herausragende Leistungen zu erbringen und sich in Ihrem Fachgebiet hervorzuheben.
Lab Molekulardockung, Dauer 16 Stunden
Lab-Preis: 2 000 EUR inkl. MwSt. pro Einheit
Sprachen: Englisch oder Französisch
Lab CHARMM™
Machen Sie Fortschritte in der molekularen Modellierung mit unserer Schulung, die speziell für die Untersuchung von RNA und DNA bei Mukoviszidose auf CHARMM™ entwickelt wurde. Während dieser intensiven Schulung beherrschen Sie die Schlüsselwörter dieser Sprache, einschließlich (die Module werden ins Französische übersetzt, sofern französischsprachig). Sie konzentrieren sich daher auf die Manipulationen und Kraftgleichungen, die Sie auf RNA und DNA anwenden.
Diese praktische Arbeit erfordert Kenntnisse in thermodynamischer Physik und organischer Chemie auf einem Niveau von drei Universitätsjahren.
Lab NAMD
NAMD wurde von der University of Illinois in Urbana-Champaign entwickelt und ist ein Programm, das in der biophysikalischen, biochemischen und computergestützten Biologieforschung weit verbreitet ist, um verschiedene molekulare Prozesse wie Proteinkonformationsänderungen, Protein-Ligand-Wechselwirkungen und Membrandynamik zu untersuchen.
NAMD ist eine molekulare Simulationssoftware, die sich hauptsächlich auf die Molekulardynamik großer biologischer Systeme konzentriert. Der Name steht für „NAnoscale Molecular Dynamics“. NAMD ist auf Schnelligkeit und Skalierbarkeit ausgelegt und wird häufig zur Simulation komplexer biomolekularer Systeme wie Proteine, Nukleinsäuren und Zellmembranen eingesetzt.
Diese praktische Arbeit erfordert Kenntnisse in thermodynamischer Physik und organischer Chemie auf einem Niveau von drei Universitätsjahren.
NAMD verwendet fortschrittliche Näherungstechniken, um Molekulardynamiksimulationen zu beschleunigen, wie beispielsweise die Interaktionsnetz-Ewald-Methode, und ermöglicht so die Untersuchung großer Systeme auf erheblichen Zeitskalen.
Unsere Schulung führt Sie durch jeden Schritt des Simulationsprozesses, von der Vorbereitung der Systeme bis zur Analyse bekannter Ergebnisse der Lyme-Borreliose. So können Sie die biophysikalischen Wechselwirkungen mit den bereits bekannten Daten zu dieser Krankheit verstehen.
Lab 1 : Erste Schritte mit allen Modulen und dem Geist des Softwarepakets, Dauer 16 Stunden
Lab 2 : Modellierung und Berechnung freier Energien, Dauer 8 Stunden
Lab-Preis: 2 000 Euro inkl. MwSt. pro Einheit
Preis: 3 000 Euro inkl. MwSt., beides
Sprachen: Englisch oder Französisch
Lab GROMACS
Diese Schulung vermittelt Ihnen ein tiefgreifendes Verständnis von GROMACS und deckt die folgenden Aspekte ab:
Einführung in GROMACS : Verstehen Sie die Grundprinzipien, seine Geschichte, seine Anwendungen und seine Bedeutung in der biomolekularen Forschung.
Installation und Konfiguration : Erfahren Sie, wie Sie GROMACS auf verschiedenen Plattformen installieren und konfigurieren, einschließlich Personalcomputern.
Prinzipien der molekularen Simulation : Verstehen Sie die theoretischen Grundlagen der Molekulardynamik und Monte-Carlo-Simulationen sowie die in GROMACS verwendeten Algorithmen.
Simulationssysteme vorbereiten : Erfahren Sie, wie Sie molekulare Systeme für die Simulation vorbereiten, einschließlich der Erstellung von Krafttopologien und der Vorbereitung von Eingabedateien.
Ausführen von Simulationen : Beherrschen Sie die Befehle und Befehlszeilenoptionen zum Ausführen molekularer Simulationen, optimieren Sie die Leistung und interpretieren Sie die Ergebnisse.
Simulationsdatenanalyse : Erfahren Sie, wie Sie Simulationsergebnisse mithilfe der in GROMACS integrierten Tools sowie anderer Verarbeitungs- und Visualisierungssoftware analysieren.
Erweiterte Anwendungen : Entdecken Sie erweiterte Anwendungen von GROMACS wie die Simulation von Membransystemen und Berechnungen zur Arzneimittelbindung.
Lab VMD
Ob Sie nun Forscher in der Biophysik, der Computerchemie oder der Strukturbiologie sind, Diese Schulung vermittelt Ihnen die wesentlichen Fähigkeiten, um die Analyse und Visualisierung komplexer molekularer Strukturen zu beherrschen. Sie lernen, wie man Proteine, Nukleinsäuren und Lipide visualisiert und manipuliert.
Mit VMD können Sie die dreidimensionale Struktur Ihrer Moleküle grafisch darstellen, molekulare Eigenschaften berechnen und dynamische Animationen zur Darstellung der Moleküldynamik erstellen. Unsere Schulung führt Sie durch alle Funktionen von VMD, von der Manipulation von Strukturen bis hin zur erweiterten Analyse von Simulationsergebnissen.
Unsere Bioinformatiker bieten Ihnen ein Erlebnis, das Ihren Ansatz zur molekularen Visualisierung revolutionieren und neue Forschungsperspektiven im spannenden Bereich der Strukturbiologie eröffnen wird!
Lab VMD, Dauer 10 Stunden
Labpreis: 1 500 Euro inkl. MwSt. pro Einheit
Sprachen: Englisch oder Französisch
Lab Cytoscape®
Cytoscape® wurde vom Institute of Systems Biology in Seattle entwickelt und bietet eine benutzerfreundliche Oberfläche und leistungsstarke Funktionen zur Erforschung der Struktur und Dynamik biologischer Netzwerke. Benutzer können Netzwerkdaten aus verschiedenen Quellen, beispielsweise öffentlichen Datenbanken oder lokalen Dateien, importieren und sie als interaktive Diagramme visualisieren.
Cytoscape® ist eine weit verbreitete Open-Source-Softwareplattform zur Visualisierung, Analyse und Manipulation komplexer Netzwerke wie biologischer Netzwerke, Protein-Interaktionsnetzwerke und vielen anderen.
Lab Microsoft Word®
Der Begriff „Office Pack“® bezieht sich im Allgemeinen auf die von der Microsoft Corporation entwickelte Microsoft Office® Office-Suite. Diese Software-Suite umfasst mehrere beliebte Programme, die in geschäftlichen, pädagogischen und privaten Umgebungen verwendet werden. Wir stellen Ihnen die Hauptkomponenten von Microsoft Word® vor, einem Textverarbeitungsprogramm, das häufig zum Erstellen und Formatieren von Dokumenten wie Berichten, Briefen usw. verwendet wird.
Entdecken Sie unsere Schulung zu Microsoft Word®, die speziell für diejenigen entwickelt wurde, die Schwierigkeiten mit den vielen Funktionen und Verknüpfungen der Software haben! Ganz gleich, ob Sie Anfänger sind oder einfach nur Ihre Kenntnisse vertiefen möchten, dieses Training hilft Ihnen, Word® einfach und effektiv zu beherrschen.
Wir führen Sie durch alle wesentlichen Funktionen, von der Erstellung und Formatierung von Dokumenten bis hin zum Hinzufügen von Bildern, Tabellen und Diagrammen. Sie erfahren, wie Sie mit den Layout-Tools professionelle, ansprechende Dokumente erstellen und wie Sie mit den Überprüfungsfunktionen mit anderen Benutzern an Projekten zusammenarbeiten. Wir konzentrieren uns auch auf den effektiven Einsatz von Autokorrektur, Nummerierung, Aufzählungslisten und Textstilen, um Zeit zu sparen und die Konsistenz Ihrer Dokumente zu verbessern.
Lab Microsoft Word®, Dauer 10 Stunden
Labpreis: 1 500 Euro inkl. MwSt. pro Einheit
Sprachen: Englisch oder Französisch
Lab ggplot2®
ggplot2® ist eine Diagrammbibliothek in R, entwickelt von Hadley Wickham. Diese Bibliothek basiert auf dem Prinzip der „Grammar of Graphics“, das einen kohärenten und systematischen Ansatz zur Erstellung von Grafiken durch Zerlegung grafischer Elemente in verschiedene Ebenen bietet.
Wir stellen ggplot2® als ein Dienstprogramm vor, das es Benutzern ermöglicht, mithilfe einer Reihe einfacher und intuitiver Funktionen komplexe und ästhetisch ansprechende Diagramme zu erstellen. Es bietet große Flexibilität bei der individuellen Anpassung aller Aspekte des Diagramms, einschließlich Farben, Formen, Legenden, Skalen usw.
ggplot2® wird häufig im Bereich der Datenanalyse und -visualisierung eingesetzt, insbesondere im Kontext von Data Science, akademischer Forschung und der Veröffentlichung wissenschaftlicher Ergebnisse.
